2014년 10월 스페인 검찰이 2010-2011시즌 스페인 프리메라 리가에서의 승부조작 사태에 대해 집중 조사를 벌이고 있는 가운데 당시 레알 사라고사를 이끌던 아기레 감독이 승부조작에 연루됐다는 의혹을 받기도 했으나, 본인과 일본축구협회는 전면 부인했다. 2014년 11월 10일 멕시코 기업이 주최하는 '축구 명예의 전당' 시상식에 참석하기 위해 멕시코로 떠나며 사상 초유의 감독 팀 이탈 논란을 불러일으켰다. 11월 14일 A매치 평가전을 앞두고 훈련 중인 대표팀을 놔두고 간 것이어서 일본 국민의 반감을 사고 있다.[5] 2014년 12월 15일 스페인 검찰이 법원에 제출한 2011년 승부조작 사건 공소장에 피의자로 적시되며 기소당했다.# 2015년 1월 14일 스페인 검찰청에서 정식으로 발렌시아 법원에다가 고발장을 접수하면서 아시안컵 운영에도 차질이 예상된다.## 여기다 아시안컵 8강 광탈까지 겹치면서 경질될 것으로 보였다. 하지만 일본축구협회장이 '당분간 유임'이라는 뜻을 표명했다.
그러나 스페인 당국에서 아기레의 고발장을 정식으로 수리함에 따라 일본축구협회에서도 국가대표팀에 미칠 부정적인 영향을 막기 위해 2015년 2월 3일에 아기레를 해임하고, 후임 감독으로 바히드 할릴호지치를 영입했다. 하지만 아기레 본인은 여전히 자신은 무죄라고 주장 중.
